农业农村部华南果蔬绿色防控重点实验室是农业农村部作物有害生物综合治理学科群重点实验室，依托仲恺农业工程学院、广东省农业科学院植物保护研究所与广西壮族自治区农业科学院联合共建，聚焦华南地区果蔬有害生物绿色防控领域，集科技创新、技术研发、人才培养、成果转化、社会服务等功能于一体的科技创新平台，于2022年经农业农村部批准正式成立。

实验室立足华南，通过基于现代生物技术、高分辨率多光谱技术、遥感技术和信息技术等，开展华南果蔬重大、新发有害生物分子检测、快速诊断技术和智能化监测预警技术研究；基于分子生物学技术、多组学技术、化学生态学技术，解析华南果蔬重大和新发有害生物致害成灾机制；基于生物技术、微生物群体猝灭技术、纳米技术和生态调控等技术，开发精准绿色防控新产品及技术解决方案，并优化集成示范与应用。面向学科发展前沿、国家战略和华南区域产业发展需求，聚焦华南果蔬有害生物精准高效绿色防控应用基础和技术研究，为华南果蔬产业绿色发展提供科技支撑。

实验室建成了一支从事果蔬病虫害绿色防控领域的基础和应用基础研究的科研队伍。实验室主任由仲恺农业工程学院校长程萍教授担任，副主任为广东省农业科学院植物保护研究所何自福研究员、广西壮族自治区农业科学院于永浩研究员。学术委员会主任为康振生院士。目前固定研究人员共149人，其中正高级职称46人，副高级职称60人，中级职称40人，博士学历111人，硕士学历32人。