广西壮族自治区农业科学院园艺研究所成立于1956年，是以热带、亚热带果树、西甜瓜等农作物遗传育种及栽培技术研究为主的多学科研究所。现有在职职工73人，其中高级职称50人，中级职称13人，博士14人，硕士43人。设有西甜瓜研究室、荔枝龙眼研究室、热带特色果树研究室、柑橘育种研究室、柑橘栽培研究室、热带优稀果树研究室、落叶果树研究室、火龙果研究室。

本所科研实验仪器和基础设施先进齐全，拥有园艺植物组织培养实验室、生理生化实验室、果品分析室及果树分子实验室等。建立了南宁院部、武鸣里建、崇左龙州果树基地及隆安丁当荔枝龙眼育种基地等多个科研基地。主要开展西甜瓜、荔枝、龙眼、柑橘、火龙果、芒果、百香果、菠萝、杨桃、香蕉、无花果、番荔枝等园艺作物资源收集保存、评价利用、品种选育和配套技术创新研究。选育品种98个，获授权专利205件，获国家、省部级科技奖励45项。

承担有农业部南宁南亚热带果树科学观测实验站、国家种质资源武鸣观测实验站、广西西甜瓜工程技术研究中心、广西壮族自治区农业良种培育中心、广西柑橘黄龙病防控工程技术研究中心；同时承担国家荔枝龙眼产业技术体系良种繁育及配套技术岗位、国家西甜瓜产业技术体系南宁综合试验站、国家柑橘产业技术体系桂中南综合试验站、国家香蕉产业技术体系芒果广西百色综合试验站、广西特色水果创新团队8个岗位（含首席专家岗位、菠萝育种栽培与病虫害防控岗位、火龙果育种与栽培功能专家岗位、火龙果南宁综合试验站、百香果南宁综合试验站、西甜瓜育种及栽培功能专家岗位、菠萝防城港综合试验站、热带优稀果树南宁综合试验站）、广西荔枝龙眼创新团队岗位育种与栽培岗位专家、广西柑橘创新团队桂中南试验站以及10个广西特色作物试验站（灵山荔枝、武鸣柑橘、田东芒果、大新龙眼、天峨珍珠李、北海西瓜、容县沙田柚、陆川橘红、乐业猕猴桃）的相关研究平台与试验任务。(数据截止至2024年8月)