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甘蔗所团队在国际知名微生物学期刊Frontiers in Microbiology发布世界上首例竹荪参考基因组
  • 发布单位:甘蔗研究所
  • 2023-02-10 10:34:07
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近日,甘蔗所数字甘蔗创新研究团队联合蔬菜所设施蔬菜研究团队、微生物所药用真菌研究团队、来宾分院以及广西丹桂鲜农业科技发展有限公司在国际知名微生物学期刊《Frontiers in Microbiology》(中科院微生物学2区,2022年影响因子:6.064)在线发表题为“Genome, transcriptome, and metabolome analyses provide new insights into the resource development in an edible fungus Dictyophora indusiata”的研究论文。甘蔗所为第一完成单位,段明政博士为第一作者,龙盛风副研究员为并列第一作者,陈振东研究员与王泽平博士为共同通讯作者。

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竹荪在东亚国家广泛种植,非常适合与甘蔗间作,是一种能提高甘蔗栽培经济附加值的优秀菌类作物。然而,在竹荪栽培与利用过程中,因对子实体形成过程中的生理、分子与代谢背景了解不足,常导致产量、品质降低,种植成本偏高;对竹荪子实体的开发利用率存在不足,导致大量生物质浪费。为解决以上问题,攻关团队自2020年以来在桂北、桂中、桂南地区连续多年多点开展“甘蔗+竹荪”间套种试验。通过此次研究,构建了国际上首个竹荪参考基因组,大小为67.32 Mb,由323个contigs构成;鉴定出19909个编码基因,其中46个基因簇与萜类化合物合成有关;多组学分析验证了3个来自色氨酸代谢通路参与IAA合成的功能基因,这些基因可能具有调控竹荪子实体分化的能力。

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竹荪基因组数据已上传至美国国家生物技术信息中心(NCBI),以供全球相关科研工作者共享。此次联合研究极大扩展了目前对竹荪资源的认识与开发,更新了对竹荪子实体发育与分化分子机制的认识,为进一步科学建立“甘蔗+竹荪”间套种模式提供了生物信息学蓝本。该工作得到了广西科技特派员乡村“科技富民”示范项目“蔗叶、蔗梢及蔗渣作为竹荪培育基质配方优化和高产栽培技术规程建立”的重点支持。

甘蔗所  王泽平供稿/供图  黄东亮审核

责任编辑:薛臣艺